Flamastry mają różne zastosowania w zależności od konstrukcji końcówki i składu tuszu. Klasyczny flamaster, taki jak STABILO Pen 68, nadaje się przede wszystkim do intensywnego kolorowania. Można go jednak używać także z pędzlem do efektów akwarelowych, o ile tusz na papierze jeszcze nie wysechł. Inne flamastry, takie jak STABILO Pen 68 metallic lub STABILO Trio DECO, zawierają w tuszu metaliczne cząsteczki. Dzięki temu mogą tworzyć metaliczne, błyszczące efekty na zwykłym papierze, a także szczególnie intensywne efekty na ciemnym i czarnym papierze lub nawet na gładkich powierzchniach, takich jak folie, szkło czy bombki choinkowe. Brush peny, takie jak STABILO Pen 68 brush, mają elastyczną końcówkę pędzelkową i dlatego idealnie nadają się do handletteringu.